Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PlnP61014 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PlnP61014 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PlnP61014 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms