Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms