Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdo1P60334 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms