Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rin3P59729 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms