Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms