Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P58686 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P58686 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P58686 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P58686 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P58686 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P58686 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P58686 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P58686 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P58686 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P58686 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P58686 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P58686 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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P58686 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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P58686 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms