Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uchl4P58321 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl4P58321 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms