Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms