Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms