Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bace1P56818 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bace1P56818 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bace1P56818 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms