Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf5P56477 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf5P56477 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf5P56477 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms