Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms