Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Abcd3P55096 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcd3P55096 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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