Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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