Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PctpP53808 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PctpP53808 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PctpP53808 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PctpP53808 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PctpP53808 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PctpP53808 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PctpP53808 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms