Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fdft1P53798 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fdft1P53798 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fdft1P53798 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms