Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RabggtbP53612 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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