Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms