Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tmod1P49813 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms