Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpreP49446 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpreP49446 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpreP49446 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PtpreP49446 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PtpreP49446 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpreP49446 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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