Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms