Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VdrP48281 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VdrP48281 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VdrP48281 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VdrP48281 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VdrP48281 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VdrP48281 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VdrP48281 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VdrP48281 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms