Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg3P47867 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg3P47867 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg3P47867 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg3P47867 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg3P47867 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg3P47867 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg3P47867 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg3P47867 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg3P47867 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms