Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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