Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms