Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms