Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms