Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sept1P42209 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sept1P42209 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms