Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd1P40201 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms