Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik2P39087 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik2P39087 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik2P39087 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik2P39087 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Grik2P39087 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Grik2P39087 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik2P39087 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik2P39087 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik2P39087 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik2P39087 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik2P39087 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik2P39087 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Grik2P39087 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms