Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms