Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprkP35822 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms