Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddit3P35639 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms