Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms