Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptk2P34152 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptk2P34152 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms