Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms