Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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