Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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