Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DcnP28654 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DcnP28654 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DcnP28654 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DcnP28654 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms