Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms