Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U2af2P26369 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms