Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms