Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Ube2uos-201ENSMUST00000142634 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm43255-201ENSMUST00000198885 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm11868-201ENSMUST00000121594 1478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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Hoxd11P23813 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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Hoxd11P23813 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Hoxd11P23813 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms