Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpcP21841 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms