Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms