Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a2P20490 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms