Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F3P20352 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F3P20352 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F3P20352 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
F3P20352 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F3P20352 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F3P20352 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F3P20352 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F3P20352 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F3P20352 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F3P20352 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F3P20352 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms