Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VimP20152 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VimP20152 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VimP20152 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VimP20152 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VimP20152 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VimP20152 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VimP20152 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms