Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P20040 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P20040 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P20040 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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