Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NefhP19246 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NefhP19246 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NefhP19246 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NefhP19246 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NefhP19246 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NefhP19246 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NefhP19246 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms